宏量营养素需求直接决定了发酵培养基的成分以及中试发酵罐供应气体的方式。 碳提供细胞物质和代谢能量,氮支持蛋白质和核酸的合成,而氧作为末端电子受体,实现需氧能量的产生。因此,培养基组成、补料策略、搅拌、喷射器设计、溶氧控制和尾气分析必须作为一个相互关联的系统进行设计。
核心设计原则是物质和电子平衡: 培养基必须以生物体能够利用的形式和数量提供碳和氮,而气体传递系统必须以足够快的速度输送氧气以满足细胞需求,同时避免过度的剪切力、泡沫或过高的运行成本。
为什么宏量营养素控制发酵设计
宏量营养素奠定配方基础
宏量营养素的浓度需求通常大于约 10⁻⁴ M,因此它们在生长培养基和补料策略的配制中占主导地位。
所需量取决于生物体的元素组成、生长速率、产物途径和预期的生物量浓度。如果营养物质不可用、具有抑制性或投料速率错误,即使提供足够总量的营养,配方的表现也可能不佳。
培养基与生物反应器是耦合的
碳和氮主要通过液体培养基进入,而氧气通常通过空气或富氧气体供应。它们的消耗速率通过代谢相互关联,因此改变其中一项需求通常会改变其他需求。
例如,增加碳源补料可以增加生物量形成和呼吸活动。这可能会提高 耗氧速率 (OUR) 和 二氧化碳释放速率 (CER),从而需要调整搅拌、气流、氧气富集或补料控制。
碳需求如何塑造培养基配方
碳同时提供生物量和能量
葡萄糖、蔗糖、糖蜜和淀粉废料等碳源提供了细胞物质所需的碳骨架,以及通过代谢释放的能量。
在简化的需氧平衡中,大约 50% 的底物碳可能转化为生物量,50% 用于氧化产生能量。这是一个有用的规划近似值,但实际比例取决于生物体、生长条件、维持需求、产物形成和代谢途径。
碳源选择影响过程控制
纯糖类提供了相对可预测的成分和补料行为。糖蜜和淀粉废料等粗原料可以降低原材料成本,但它们引入了糖浓度、矿物质含量、粘度、污染物和灭菌需求方面的变异性。
因此,中试规模的配方既需要名义上的碳浓度,也需要操作控制策略。工艺团队应核实每批次的实际碳含量,并监测残留底物,以避免碳限制或溢流代谢。
厌氧操作改变碳效率
在厌氧条件下,根据上述简化关系,可能只有不到 30% 的底物碳转化为生物量。更大比例的碳被导向还原性发酵产物,这会改变气体产生、热量生成、产量及下游回收要求。
这种区别也影响喷射器设计。厌氧过程可能需要有限的或惰性的气体流量来进行混合、吹脱或压力控制,而不是输送氧气,而需氧过程必须以所需速率维持氧传递。
氮需求如何塑造培养基配方
氮支持细胞合成
氮是蛋白质、核酸和其他含氮细胞化合物所必需的。它通常占细胞干重的 10% 到 14%,使其成为主要的配方限制因素。
典型的氮源包括铵盐、酵母提取物和玉米浆。这些来源在同化速率、缓冲效应、微量营养素含量、渗透压以及对产物形成的影响方面各不相同。
氮平衡影响生长和产物形成
即使碳源充足,氮供应不足也会限制生物量的形成。过量的氮会改变 pH 值、增加氨相关的毒性、改变碳氮比,或将代谢方向从目标产物转移开。
因此,中试配方应根据目标生物量和产物产量来定义氮的有效性,而不是仅将氮指定为一种总量浓度。当工艺需要分阶段或氮限制的生长阶段时,可能需要补料控制。
复杂氮源增加变异性
酵母提取物和玉米浆除了提供氮外,还可以提供肽、维生素、矿物质和生长因子。它们更广泛的营养价值可以提高性能,但其成分不如无机铵盐明确。
这种变异性在放大过程中很重要,因为原材料成分的变化可能表现为生长速率、需氧量、泡沫行为或产品质量的变化。因此,原材料表征和批次间测试是中试工厂配方控制的一部分。
氧需求如何塑造喷射器设计
氧气是一种传递需求,而不仅仅是培养基成分
氧气是需氧代谢中必不可少的末端电子受体,也是生物量的重要元素组成部分,在参考基准中约占细胞干重的 20%。
然而,在发酵罐中,实际的挑战不仅仅是提供总量的氧气。氧气必须以与需求相匹配的速率从气相传递到液相,然后输送到细胞。
喷射器产生气液界面
喷射器将空气或氧气以气泡形式引入发酵液中。搅拌器保持固体悬浮,分散气泡,并能减小气泡尺寸。
较小的气泡提供更多的气液界面面积。对于近似球形的气泡,单位体积的界面面积表示为:
[ a = \frac{6}{d_b} ]
其中 (a) 是单位体积的界面面积,(d_b) 是气泡直径。因此,减小气泡直径通常会改善可用于氧传递的界面。
氧传递必须匹配细胞需求
关键的工程关系通常表示为:
[ OTR = k_La(C^* - C_L) ]
其中 (OTR) 是氧传递速率,(k_La) 是体积传质系数,(C^*) 是氧的饱和浓度,(C_L) 是实际溶解氧浓度。
该过程必须在相关操作阶段维持至少等于微生物 OUR 的氧传递速率。如果 OUR 超过 OTR,溶解氧就会下降,即使气流看起来充足,培养物也可能变得缺氧。
搅拌、气流和富氧协同工作
增加搅拌可以改善气泡分散和 (k_La),而增加气流则提高了气体供应,并可能改善氧传递。富氧增加了氧传递的驱动力,并可在仅靠空气不足时扩展容量。
每种干预措施都有局限性。搅拌会增加功率输入和剪切力,气流会增加泡沫和溢流风险,而富氧会增加运行成本并可能产生安全隐患。中试测试应建立综合的操作范围,而不是孤立地优化每个变量。
尾气数据如何支持放大
氧气和二氧化碳揭示代谢活动
当气泡穿过发酵液上升时,氧气被消耗,二氧化碳被产生。静水压力、气泡膨胀、混合和气体成分随罐体高度而变化,并影响最终的尾气信号。
测量进气和出气成分以及体积流量,使操作员能够估算 OUR 和 CER。这些测量提供了代谢的过程级视图,补充了溶解氧、pH、搅拌和底物测量。
OUR 有助于识别通气限制
OUR 的上升可能表明生物量增加或代谢活动增强。如果尽管搅拌或气流增加,溶解氧仍开始下降,则发酵罐可能已接近其氧传递能力。
这些信息在放大过程中很有价值,因为它确定了限制因素是气体流量、混合、氧浓度、压力还是可用的传质系数。仅基于罐体体积或叶轮尖端速度的放大可能会忽略这种生物限制。
CER 有助于检查碳和氧平衡
CER 提供了碳如何被代谢的证据,并有助于识别呼吸活动或产物途径的变化。将 CER 与碳补料和 OUR 进行比较,有助于揭示该过程的行为是否与预期的代谢规律一致。
尾气分析还支持检测泄漏、传感器漂移、气体混合不完全和流量测量不准确。在将数据用于放大决策之前,应解决这些测量问题。
将配方与中试工厂操作相结合
定义元素和过程平衡
稳健的配方始于预期的生物量浓度、细胞元素组成、产物途径和操作模式。应根据这些要求评估碳、氮、磷、硫、矿物质和微量元素。
配方还应考虑影响产物合成的前体。例如青霉素生产中的苯乙酸和维生素 B12 合成中的 5,6-二甲基苯并咪唑。
使补料与消耗相匹配
分批发酵、补料分批发酵和连续发酵过程使细胞处于不同的营养条件下。分批过程必须耐受初始营养状况,而补料分批过程可以随时间控制残留碳、氮有效性、生长速率和需氧量。
补料速率应与气体传递能力相协调。即使碳平衡本身看起来有利,导致 OUR 超过可用 OTR 的碳补料增加也可能降低生产率。
为全操作范围进行设计
中试设备应在预期的最高生物量、补料速率、粘度和需氧量下进行评估,而不仅仅是在起始条件下。发酵液流变学可能会在发酵过程中发生变化,从而降低混合或气体分散性能。
喷射器、搅拌器、气流系统、供氧、压力能力、消泡系统和传感器必须在此范围内协同工作。这就是宏量营养素配方与生物反应器设计之间的实际联系。
理解权衡
更高的氧传递可能会增加过程压力
更多的搅拌和更小的气泡可以改善氧传递,但它们也可能增加剪切力、功耗、热量产生和泡沫形成。最好的设计是在可接受的生物和运行后果下满足 OUR 的设计。
粗原料降低成本但增加不确定性
糖蜜、淀粉废料、酵母提取物和玉米浆可以提供经济的碳和氮。它们的变异性可能会使重现性、灭菌、下游处理和放大数据的解释变得复杂。
富氧增加了容量和风险
当基于空气的传递不足时,富氧气体可以防止缺氧。它也增加了运行成本,并需要对气体处理、材料兼容性和过程安全进行严格控制。
简化的产量规则并非普适常数
近似的需氧碳分配、厌氧生物量分数、氮百分比和元素生物量值对于初步工程估算很有用。它们不应取代特定生物体的测量,因为维持代谢、产物合成、培养龄和环境条件会实质性地改变这些平衡。
将其应用于您的中试工厂
实际的设计决策应将生物需求、配方、设备能力和测量质量联系起来。
- 如果您的主要重点是生物量生产: 设置碳和氮补料以支持目标生长速率,然后验证喷射器和搅拌器能否在峰值 OUR 下维持溶解氧。
- 如果您的主要重点是产物产量: 控制碳氮平衡和任何途径特异性前体,同时防止缺氧导致代谢转移或降低产物形成。
- 如果您的主要重点是低成本原材料: 仅在进行成分测试、补料校正以及监测需氧量和发酵液性质变异性的情况下使用粗碳源和氮源。
- 如果您的主要重点是放大: 使用 OUR、CER、(k_La)、溶解氧、气体流量和尾气成分来定义放大基础,而不是仅依赖罐体体积。
- 如果您的主要重点是厌氧发酵: 尽量减少不必要的氧传递,并围绕混合、吹脱、压力控制和预期的发酵气体成分来设计气体处理系统。
有效的中试发酵结果来自于平衡细胞的需求与培养基和气体传递系统所能可靠提供的能力。
总结表:
| 设计因素 | 关键影响 | 中试工厂考虑因素 |
|---|---|---|
| 碳 | 提供生物量和代谢能量;影响 OUR 和 CER | 选择一致的来源,控制残留底物,并使补料与氧传递能力相匹配 |
| 氮 | 支持蛋白质和核酸;影响生长和产物形成 | 平衡有效性与生物量目标,并评估复杂来源的变异性 |
| 氧 | 实现需氧能量产生,必须匹配细胞需求 | 为峰值 OUR 配备喷射器、搅拌器、气流和富氧系统 |
| 喷射器和搅拌 | 产生气液界面并改善氧分散 | 优化气泡尺寸和混合,同时限制剪切、泡沫和功率使用 |
| 尾气监测 | 提供用于代谢和放大决策的 OUR 和 CER 数据 | 共同测量进出气体、流量、溶解氧和工艺条件 |
| 放大策略 | 连接配方、补料、发酵液性质和设备能力 | 评估全操作范围,包括峰值生物量、粘度、补料速率和需氧量 |
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