知识 生物工艺与生物技术教育 了解细胞的双重生长(diauxic growth)和代谢调节如何影响利用混合糖原料的生物工艺中试发酵的运行策略?
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技术团队 · LABPARK

更新于 2 个月前

了解细胞的双重生长(diauxic growth)和代谢调节如何影响利用混合糖原料的生物工艺中试发酵的运行策略?


理解细胞的双重生长直接影响中试发酵的补料、监测和控制方式。当细胞在消耗乳糖或其他次级糖之前先消耗葡萄糖时,葡萄糖会抑制替代代谢途径,并在葡萄糖耗尽后产生过渡滞后期。识别这种行为有助于操作人员区分正常的调节转换与设备或培养失败,从而调整补料分批策略,并提高生物量或产品的一致性。

核心运行原则是将混合糖视为一种受调节的序列,而不是均匀可用的碳源池。监测底物可用性和代谢反应,使操作人员能够控制碳源之间的转换,并减少可避免的生产力损失。

为什么混合糖会产生顺序生长

优先碳源主导早期生长

在许多生物体中,葡萄糖被优先消耗,因为它支持快速的能量产生和生物量形成。只要有葡萄糖存在,细胞几乎没有动力去产生代谢替代底物所需的酶。

这创造了一个初始生长期,在此期间培养物可能表现出极高的生产力,即使乳糖或其他糖的途径仍处于非激活状态。

分解代谢阻遏限制了替代途径

葡萄糖可以降低细胞内 cAMP 的水平,从而阻止激活乳糖操纵子等基因所需的 cAMP-CAP 调节复合物的形成。因此,在葡萄糖消耗阶段,包括 β-半乳糖苷酶 在内的酶无法达到足够的合成水平。

这是一种调节分配决策:细胞避免将能量浪费在生产非即时所需的代谢机器上。

诱导物排斥强化了该序列

葡萄糖还可能导致 诱导物排斥,限制替代糖的摄取或有效诱导。即使发酵液中存在乳糖,在葡萄糖浓度降至足够低之前,细胞也可能无法有效利用它。

因此,测得的总糖浓度并不一定代表可立即用于生长的碳源。

中试工厂中的双重过渡表现

第一生长期通常很快

在葡萄糖消耗过程中,培养物可能表现出较高的生长速率、增加的氧需求和可预测的底物摄取。这通常是快速积累生物量的最有利阶段。

操作人员仍应避免假设这种行为在葡萄糖耗尽后会持续。控制策略必须考虑到下一个代谢状态。

葡萄糖耗尽可能产生暂时滞后

当葡萄糖耗尽时,由于细胞需要合成次级底物的酶和转运系统,生长可能会减慢或暂时停止。这种过渡是 双重生长 的定义特征。

在中试规模下,如果不同时结合底物和工艺数据进行解读,这种滞后可能被误认为是氧限制、营养缺乏、抑制、污染或传感器问题。

第二生长期具有不同的动力学

一旦替代糖途径被激活,生长将在乳糖或其他次级碳源上恢复。其速率可能与葡萄糖阶段不同,因为转运能力、酶表达、底物亲和力和副产物形成都已发生变化。

因此,中试规模的运行模型应允许存在 多种动力学机制,而不是将单一的生长速率应用于整个批次。

监测如何支持更好的决策

溶解氧可以揭示底物转换

当葡萄糖耗尽时,由于生长速率和呼吸需求暂时下降,耗氧量可能会减少。即使通气和搅拌没有改变,这也可能产生 溶解氧峰值。

随后氧需求的增加可能表明次级糖的代谢已经开始。

pH 值变化提供支持性证据

产酸、二氧化碳释放和底物代谢的变化会改变 pH 值的表现。在葡萄糖耗尽点附近的 pH 值偏移可以支持培养物正在代谢程序之间转换的判断。

仅凭 pH 值不能下定论,因此应结合溶解氧、生物量、补料速率以及可用的直接底物测量值进行评估。

生物量趋势识别生长阶段

在线或离线生物量测量有助于区分指数生长期、双重过渡期、稳定期和死亡期。碳源切换期间的短暂平台期符合双重调节特征,而生物量的长期损失可能表明存在其他工艺问题。

在决定是否继续补料、调整环境或收获时,这种基于阶段的解读至关重要。

直接糖测量改善控制

残留葡萄糖和乳糖的测量提供了底物顺序和耗尽的最清晰证据。它们可用于验证基于溶解氧、二氧化碳、pH 值和生物量的软传感器。

如果没有直接或经过良好验证的间接测量,操作人员可能会冒着基于总糖浓度进行补料的风险,而此时细胞在生理上只能利用其中一种成分。

运行策略应如何改变

围绕调节状态设计补料

在补料分批操作中,补料成分和时间应反映哪些途径处于活跃状态。富含葡萄糖的补料可以维持快速生长,但可能会继续抑制乳糖利用并延长后续的过渡期。

如果所得的生长速率和产品目标仍然可以接受,受控地减少葡萄糖供应可以促进替代途径的更早激活。

避免过度补料优先底物

过度补料葡萄糖会导致几个问题:

  • 延长对次级底物途径的抑制。
  • 积累抑制性的有机酸或其他副产物。
  • 过高的氧需求和增加氧限制的风险。
  • 向第二碳源的转换延迟或同步性差。

因此,正确的葡萄糖补料量是由预期的生理状态决定的,而不是简单地由最大可能的补料速率决定。

在适当的情况下使用分段或混合补料

分段策略可以允许在葡萄糖上进行初始生物量形成,随后有意转换为乳糖或其他底物。混合补料可能会降低切换的突发性,但如果葡萄糖保持在调节阈值以上,它不一定会消除抑制。

合适的设计取决于工艺是优先考虑快速生物量积累、稳定的产品形成,还是所有可用糖的持续利用。

维持过渡所需的条件

次级生长期需要的不仅仅是底物的可用性。当细胞表达新的代谢机器时,必须维持充足的氧传递、pH 控制、温度、混合和微量营养素。

因此,成功的过渡可能需要补料和设备操作的协调变化,特别是在规模扩大、混合或氧传递限制变得更加显著的情况下。

将代谢状态与产品目标联系起来

生物量生产需要保护指数生长

如果生物量是主要产品,运行策略应最大化生产性生长,同时避免过度的底物积累和不必要的双重延迟。葡萄糖可用于支持早期的快速生长,并管理过渡,使次级糖做出贡献,而不是成为可避免停机时间的来源。

收获时间应基于生物量生产力和培养健康状况,而不仅仅是批次运行时间。

次级代谢产物可能需要不同的策略

某些产品(包括抗生素等次级代谢产物)主要是在净生长减慢或停止后产生的。在这些工艺中,延长指数生长并不一定有益。

操作人员必须确定所需产品是与生长期、稳定期还是它们之间的过渡期相关,然后相应地设置补料和收获策略。

产品形成可能在碳源切换期间发生变化

改变碳源会改变中心代谢通量、副产物形成、氧化还原平衡和前体可用性。即使生物量继续增加,特定产品的形成速率也可能在双重过渡期间或之后发生变化。

因此,中试运行应在跟踪生物量和残留糖的同时,跟踪产品浓度和生产力。

理解权衡

消除滞后并不总是正确的目标

减少双重滞后可以提高体积生产力,但强行提前利用替代糖可能会降低最大生长速率或使控制复杂化。最佳策略取决于所损失的时间是否比获得的代谢灵活性成本更高。

双重行为是一种生物反应,并不自动意味着运行错误。

混合糖成分可能发生变化

生物质水解产物通常含有不同比例的葡萄糖、乳糖和其他化合物。成分的变化可能会改变批次之间抑制、耗尽、酶诱导和副产物形成的时间。

因此,前馈假设应通过实时或在线测量进行验证。

放大可能会夸大过渡问题

在中试规模下,不完美的混合和氧传递限制可能使培养物经历与容器平均值不同的局部底物浓度。在实验室反应器中看起来控制良好的过渡,在更大的容器中可能会变得不均匀或延长。

在解释代谢信号时,应考虑搅拌、通气、背压、补料位置和混合时间。

传感器信号不是唯一的诊断依据

溶解氧峰值或 pH 值变化可能表明碳源耗尽,但类似的信号也可能源于氧传递变化、探头问题、温度偏移或补料中断。操作人员应避免仅根据一个信号改变工艺。

最稳健的决策是将多个指标与已知的碳平衡和补料历史相结合。

为您的目标做出正确的选择

根据预期的培养状态和产品结果选择运行策略:

  • 如果您的主要重点是快速生物量积累:将葡萄糖补料控制在预期摄取能力附近,防止抑制性过量补料,并在产生的滞后影响生产力之前管理向次级糖的切换。
  • 如果您的主要重点是完全利用混合糖:尽可能直接测量残留糖,设计分段或混合补料,并验证葡萄糖已降至足以允许替代途径激活的水平。
  • 如果您的主要重点是次级代谢产物生产:确定与产品形成相关的生长阶段和稳定期,然后避免在不提高特定生产力的情况下延长生物量生长的补料策略。
  • 如果您的主要重点是中试规模工艺的稳健性:关联溶解氧、pH 值、生物量、二氧化碳、补料历史和残留糖,以便将双重过渡与氧传递、混合或仪器问题区分开来。

理解双重生长将混合糖发酵从一个简单的补料问题转变为一系列可控的生理状态序列。

总结表:

工艺重点 关键风险 推荐运行策略 关键指标
快速生物量生长 葡萄糖过量补料、氧限制和副产物积累 在摄取能力附近补料葡萄糖,并管理向次级糖的过渡 生物量、葡萄糖、溶解氧、pH 值、二氧化碳
完全利用混合糖 葡萄糖阻遏延迟次级糖消耗 使用分段或混合补料,并直接验证残留糖 葡萄糖、乳糖或次级糖、生物量、耗氧量
次级代谢产物生产 延长生长可能降低特定生产力 使补料和收获与产品的生长或稳定期保持一致 产品浓度、生产力、生物量、残留糖
中试规模稳健性 混合、氧传递或传感器问题可能模拟双重过渡 将多个工艺信号与补料历史和碳平衡相关联 溶解氧、pH 值、生物量、二氧化碳、补料速率
放大控制 局部底物梯度延长或破坏过渡稳定性 评估搅拌、通气、背压、补料位置和混合时间 混合性能、氧传递能力、底物分布

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